La phase 2000-2002 a mis un accent particulier sur le respect des outils de planification sans occulter la poursuite du développement participatif et d'appui aux initiatives des producteurs (paysans) à la base. Elle s'est attellé également - et ceci de manière forte - à la recherche de l'autofinancement afin d'assurer la viabilité de l'ENATEF au vu du désengagement progressif de la Coopération Suisse.
Les points saillants de cette phase ont été :
Retrait du personnel expatrié;
Diminution progressive de l'appui de la Coopération suisse;
Renforcement des acquis;
Démarrage des formations en informatique
Cours d'informatique aux élèves de 3ème année.
Concertation avec des villageois pour le choix de parcelles à reboiser.